Köögiviljade lüofiliseerimisseadmed Läbilaskev raamistik muudab külmkuivatatud köögiviljad transpordi ajal väga haavatavaks. 

Taimsete lüofiliseerimisseadmete jaoks sageli kasutatavad pakenditooted on PE-kotid ja ka kerged alumiiniumfooliumist kotid. Külmkuivatatud köögiviljadel on pärast köögiviljade lüofilisaatoriga töötlemist poorne käsnataoline struktuur. Toodet on lihtne märjaks võtta ja õhu kätte sattudes oksüdeeruda, seega tuleks külmkuivatatud köögiviljad olla vaakumpakendatud, eelistatavalt lämmastikuga täidetud; teiseks on köögiviljade lüofiliseerimisseadmetest pärit köögiviljade kogus üsna suur, mis ei aita pakendamiseks, transpordiks ega ka müügiks. Olenemata sellest, milliseid pakketooteid kasutatakse, on hädavajalik, et need oleksid täidetud lämmastikuga, samuti hapnikupüüdja ja kuivatusaine. 

Taimsete lüofilisaatorite esemeid tuleb hoida jahedas ja kuivas kohas. Võimaluse korral on parem paigutada madala õhuniiskusega ja madala temperatuuriga keskkonda. Säilivusaeg on tavaliselt 2 kuni 3 aastat. Seda saab korralikult laiendada, kui see on raudkonteinerites.